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Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften

Abteilung Mykologie: Prof. Dr. Gerhard Rambold

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3 — Biodiversitäts- und Ökoinformatik

Arbeits- und Datenflüsse

Das Sammeln, Modellieren, Verarbeiten, Analysieren, nachhaltige Archivieren und Abrufen von Daten über die biologische Vielfalt wird zu einem wesentlichen Element im Zentrum der ökologischen Forschungstätigkeit. Gegenstand sind Organismen, ihre Identität, Eigenschaften (einschließlich morphologischer, anatomischer und natürlicher chemischer Merkmale, Verhalten), Vorkommen oder Herkunft ("Raum-Zeit-Beziehungʻ), gegenseitige Beziehungen und ihre Auswirkungen auf die Umwelt. Es gibt bereits eine Vielzahl von Informationssystemen und Internetplattformen, in denen Biodiversitätsdaten von verschiedenen Institutionen, Initiativen und Forschungsprojekten erfasst und ausgewertet werden. Die Ökoinformatik widmet sich der Entwicklung von informationstechnischen Konzepten und informationstechnischen Anwendungen für das Management und die Analyse ökologischer Daten auf der Ebene von Ökosystemen.

Im Rahmen verschiedener Verbundprojekte wurden und werden in Zusammenarbeit mit dem IT-Zentrum der SNSB (München) Datenbankanwendungen sowie Schnittstellen und Werkzeuge zur Datenanalyse konzipiert und implementiert, um Forschungsdaten zu verarbeiten und zu veröffentlichen. Die Arbeitsgruppe ist an der Weiterentwicklung der folgenden Anwendungen und Datenportale beteiligt:

MycologyNet PhycologyNet Deemy LIAS Mycophylogeny Diversity Workbench Diversity Navigator NaviKey

Aktuelle Projekte (mit Hauptschwerpunkt auf diesem Forschungsfeld)

[ehem.] BMBF 01LIO205Mitwirkung an der kontinuierlichen Fortentwicklung von Datenbanken und Rich Client von Diversity Workbench-Framework-Komponenten in Kooperation mit dem IT-Zentrum der Staatlichen Naturwissenschaftlichen Sammlungen Bayerns (SNSB) und dem Julius-Kühn Institut JKI, Berlin)
Gerhard Rambold
Z_Myk_2000-02Weiterentwicklung verschiedener Biodiversitäts-Internetportale in Kooperation mit dem IT-Zentrum der Staatlichen Naturwissenschaftlichen Sammlungen Bayerns (SNSB)
Gerhard Rambold
Z_Myk_2001-01Fortentwicklung der beiden Java-basierten Datanbank-Clients NaviKey und Diversity Navigator in Kooperation mit dem IT-Zentrum der Staatlichen Naturwissenschaftlichen Sammlungen Bayerns (SNSB)
Dieter Neubacher, Gerhard Rambold

Aktuelle Projekte (mit Nebenschwerpunkt auf diesem Forschungsfeld)

Sonderforschungsbereich 1357 Mikroplastik: C04Einfluss mikrobieller Diversität und Biofilmbildung auf Abbaumechanismen von Mikroplastik-Partikeln in der Umwelt
Gerasimos Gkoutselis, Gerhard Rambold, Marcus A. Horn, Martin Obst

Abgeschlossene Projekte (mit Hauptschwerpunkt auf diesem Forschungsfeld)

BMBF 01LI1501MGBOL-Verbund: German Barcode of Life – Von der Wissenschaft zur Anwendung (GBOL-2) – Teilprojekt 12: Design und Implementierung von pilzspezifischen Microarrays ('EcoChips') für die Diagnostik
Janno Harjes, Gerhard Rambold
BMBF 01LIO202Ausbau des globalen Informationssystems LIAS durch Implementierung einer neuen Datenbankkomponente Diversity CharacterDocumentation sowie zweier neuer Internet-Komponenten
Gerhard Rambold
BMBF 01LIO205Aufbau und Optimierung der knotenspezifischen Informatik-Infrastruktur (Diversity Workbench-Komponenten und kompatible Module)
Gerhard Rambold
BMBF/DLR UF-UFLCO1263600 – 01LC0024BIOTA S04/S05: Biologische Krusten – Informatik
Luciana Zedda, Dieter Neubacher, Gerhard Rambold
BMBF GBIF-D Biodiversitäts-InformatikGBIF Deutschland IT-Fachgruppe
Alexandra Kehl, Gerhard Rambold
DFG INST 2850/1-1Aufbau eines Informationsnetzes für biologische Forschungsdaten von der Erhebung im Feld bis zur nachhaltigen Sicherung in einem Primärdatenrepositorium
Alexandra Kehl, Gerhard Rambold
DFG RA 731/11-2I-B-F: Aufbau eines Informationsnetzes für biologische Forschungsdaten von der Erhebung im Feld bis zur nachhaltigen Sicherung in einem Primärdatenrepositorium
Alexander Guhr, Gerhard Rambold
DFG RA 731/16-1Towards an integrative and comprehensive standard for meta-omics data of collection objects (MOD-CO)
Gerhard Rambold

Abgeschlossene Projekte (mit Nebenschwerpunkt auf diesem Forschungsfeld)

BMBF 01LC0024ABIOTA S04: Monitoring von Flechtendiversität im südlichen Afrika sowie Entwicklung eines Management- und Analysensystems für georeferenzierte lichenologische Daten
Luciana Zedda, Gerhard Rambold
BMBF/DLR 01LC0024BIOTA S-B2: Aufbau eines Langzeit-Monitoringsystems zur Analyse von Diversitätsverschiebungen bodenbewohnender Flechten im südlichen Afrika, basierend auf ökologischen Zeigerwerten flechtenmorphologischer Gruppen
Luciana Zedda, Gerhard Rambold
DFG 444 BRA-113/58/0-1Wissenschaftliche Zusammenarbeit mit Brasilien im Rahmen des Abkommens mit CNPq Ausschreibung Nr. 71
Marcela E. da S. Cáceres, Gerhard Rambold
DFG RA 731/5-1; FE 579/1Globale Diversität von Flechten
Gerhard Rambold
FKZ 28W-C-4-122-03 HöhengradientHöhen - und Bewirtschaftungsgradient in einem deutschen Mittelgebirge zur Abschätzung von Veränderungen in Waldökosystemen im Klimawandel
Daniel Osieko Okach, Gerhard Rambold
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