3 — Biodiversitätsinformatik
Biodiversitäts- und Ökoinformatik, Arbeits- und Datenflüsse
Die Erfassung, Modellierung, Aufbereitung, Analyse, sowie nachhaltige Archivierung und Wiederbereitstellung von Biodiversitätsdaten rückt als wesentliches Element ins Zentrum ökologischer Forschungsaktivitäten. Gegenstand sind Organismen, deren Identität, Eigenschaften (u. a. morphologische, anatomische und naturstoffchemische Merkmale, Verhalten), Vorkommen bzw. Herkunft (,Raum-Zeit-Bezugʻ), wechselseitige Beziehungen sowie deren Wirkungen auf die Umwelt. Es existiert bereits eine Vielzahl von Informationssystemen bzw. Internetplattformen, in welchen Biodiversitätsdaten unterschiedlicher Institutionen, Initiativen und Forschungsprojekten erfasst und analysiert werden. Die Ökoinformatik widmet sich der Entwicklung informationstechnischer Konzepte und informationstechnischer Anwendungen zur Verwaltung und Analyse ökologischer Daten auf ökosystemarer Ebene. Hierbei wird neben beschreibenden qualitativen Daten auch eine Vielzahl quantitativer Messdaten erfasst.
Im Rahmen zweier Verbundprojekte (BMBF: BIOTA und GBIF-Deutschland), eines EU-Projekts (4D4 Life) und eines DFG-Projekts (DiversityMobile, I-B-F, Teilprojekt I-B-F Eco) werden in Kooperation mit dem IT-Zentrum der Staatlichen Naturwissenschaftlichen Sammlungen Bayern Datenbankanwendungen sowie Schnittstellen bzw. Werkzeuge zur Datenanalyse konzeptioniert und implementert um damit primäre Forschungsdaten zu prozessieren und online zu publizieren. Hierbei ist die Arbeitsgruppe am weiteren Aufbau folgender Anwendungen, Informationssysteme bzw. Datenportale beteiligt:
Aktuelle Projekte (mit Hauptschwerpunkt auf diesem Forschungsfeld)
| BMBF 01LI1501M | GBOL-Verbund: German Barcode of Life – Von der Wissenschaft zur Anwendung (GBOL-2) – Teilprojekt 12: Design und Implementierung von pilzspezifischen Microarrays ('EcoChips') für die Diagnostik Janno Harjes, Gerhard Rambold |
| [ehem.] BMBF 01LIO205 | Mitwirkung an der kontinuierlichen Fortentwicklung von Datenbanken und Rich Client von Diversity Workbench-Framework-Komponenten in Kooperation mit dem IT-Zentrum der Staatlichen Naturwissenschaftlichen Sammlungen Bayerns (SNSB) und dem Julius-Kühn Institut JKI, Berlin) Gerhard Rambold |
| Z_Myk_2000-02 | Weiterentwicklung verschiedener Biodiversitäts-Internetportale in Kooperation mit dem IT-Zentrum der Staatlichen Naturwissenschaftlichen Sammlungen Bayerns (SNSB) Gerhard Rambold |
| Z_Myk_2001-01 | Fortentwicklung der beiden Java-basierten Datanbank-Clients NaviKey und Diversity Navigator in Kooperation mit dem IT-Zentrum der Staatlichen Naturwissenschaftlichen Sammlungen Bayerns (SNSB) Dieter Neubacher, Gerhard Rambold |
Abgeschlossene Projekte (mit Hauptschwerpunkt auf diesem Forschungsfeld)
| BMBF 01LIO202 | Ausbau des globalen Informationssystems LIAS durch Implementierung einer neuen Datenbankkomponente Diversity CharacterDocumentation sowie zweier neuer Internet-Komponenten Gerhard Rambold |
| BMBF 01LIO205 | Aufbau und Optimierung der knotenspezifischen Informatik-Infrastruktur (Diversity Workbench-Komponenten und kompatible Module) Gerhard Rambold |
| BMBF/DLR UF-UFLCO1263600 – 01LC0024 | BIOTA S04/S05: Biologische Krusten – Informatik Luciana Zedda, Dieter Neubacher, Gerhard Rambold |
| BMBF GBIF-D Biodiversitäts-Informatik | GBIF Deutschland IT-Fachgruppe Alexandra Kehl, Gerhard Rambold |
| DFG INST 2850/1-1 | Aufbau eines Informationsnetzes für biologische Forschungsdaten von der Erhebung im Feld bis zur nachhaltigen Sicherung in einem Primärdatenrepositorium Alexandra Kehl, Gerhard Rambold |
| DFG RA 731/11-2 | I-B-F: Aufbau eines Informationsnetzes für biologische Forschungsdaten von der Erhebung im Feld bis zur nachhaltigen Sicherung in einem Primärdatenrepositorium Alexander Guhr, Gerhard Rambold |
| DFG RA 731/16-1 | Towards an integrative and comprehensive standard for meta-omics data of collection objects (MOD-CO) Gerhard Rambold |
Abgeschlossene Projekte (mit Nebenschwerpunkt auf diesem Forschungsfeld)
| BMBF 01LC0024A | BIOTA S04: Monitoring von Flechtendiversität im südlichen Afrika sowie Entwicklung eines Management- und Analysensystems für georeferenzierte lichenologische Daten Luciana Zedda, Gerhard Rambold |
| BMBF/DLR 01LC0024 | BIOTA S-B2: Aufbau eines Langzeit-Monitoringsystems zur Analyse von Diversitätsverschiebungen bodenbewohnender Flechten im südlichen Afrika, basierend auf ökologischen Zeigerwerten flechtenmorphologischer Gruppen Luciana Zedda, Gerhard Rambold |
| DFG 444 BRA-113/58/0-1 | Wissenschaftliche Zusammenarbeit mit Brasilien im Rahmen des Abkommens mit CNPq Ausschreibung Nr. 71 Marcela E. da S. Cáceres, Gerhard Rambold |
| DFG RA 731/5-1; FE 579/1 | Globale Diversität von Flechten Gerhard Rambold |